Đảng ủy, Ban Chỉ huy Hải đoàn luôn chủ động nắm tình hình trên biển, tình hình hoạt động của các loại đối tượng ở địa bàn trọng điểm, vùng biên giới. Cán bộ, chiến sĩ sử dụng các biện pháp nghiệp vụ trinh sát tổng hợp cả trên biển và trên bộ, phối hợp chặt chẽ với các đơn vị hiệp đồng và cơ quan nghiệp vụ cấp trên, xây dựng phương án chiến đấu, mật phục bám biển dài ngày ở nhiều vị trí khác nhau trong điều kiện thời tiết sóng gió diễn ra phức tạp.

Những năm qua, với tinh thần cảnh giác sẵn sàng chiến đấu cao, ý chí quyết tâm tấn công các loại đối tượng, cán bộ, chiến sĩ Hải đoàn tổ chức các biên đội thường xuyên và đột xuất, bắt giữ nhiều tàu, thuyền buôn lậu, gian lận thương mại, xử phạt hành chính, tịch thu hàng hóa sung công quỹ Nhà nước.

Ngoài ra, Hải đoàn tuần tra, kiểm soát duy trì Hiệp định phân định Vịnh Bắc Bộ và Hiệp định nghề cá Việt Nam - Trung Quốc trên vùng biển Vịnh Bắc Bộ, bắt lập hồ sơ, cảnh cáo, phóng thích nhiều tàu, thuyền nước ngoài vi phạm Hiệp định, chủ quyền vùng biển Việt Nam và xua đuổi hàng nghìn lượt tàu, thuyền ra khỏi vùng biển Vịnh Bắc Bộ.

Một số kết quả cụ thể mấy năm gần đây như năm 2011, Hải đoàn bắt giữ, xử lý sáu tàu thuyền vận tải buôn lậu, gian lận thương mại; xử phạt hành chính và bàn giao cho Biên phòng các tỉnh xử lý, thu về ngân sách nhà nước hàng trăm triệu đồng; kiểm tra, kiểm soát bắt giữ lập biên bản, cảnh cáo, phóng thích tại chỗ hai tàu đánh cá nước ngoài; xua đuổi 20 lượt tàu, thuyền khác vi phạm chủ quyền ra khỏi vùng biển Vịnh Bắc Bộ.

Năm 2012, Hải đoàn triển khai ba biên đội hoạt động dài ngày trên biển, bắt giữ 17 tàu buôn lậu, gian lận thương mại, xử phạt hành chính hơn 200 triệu đồng, tịch thu hàng hóa sung công quỹ nhà nước hơn một tỷ đồng; bắt giữ, lập biên bản cảnh cáo, phóng thích tại chỗ 13 tàu thuyền nước ngoài vi phạm vùng biển Việt Nam, xua đuổi hàng chục chiếc khác ra khỏi vùng biển Vịnh Bắc Bộ.

Năm 2013, các biên đội hoạt động dài ngày trên biển của Hải đoàn đã bắt giữ, xử lý 23 tàu buôn lậu, gian lận thương mại, xử phạt hành chính hơn 126 triệu đồng, tịch thu hàng hóa tiêu hủy 7.210 lít dầu thải. Trong tuần tra, kiểm soát duy trì Hiệp định nghề cá Việt Nam - Trung Quốc trên vùng biển Vịnh Bắc Bộ, Hải đoàn đã lập 42 bộ hồ sơ tàu cá Trung Quốc, quay phim, chụp ảnh và xua đuổi 45 lượt tàu, thuyền khác ra khỏi vùng biển Việt Nam. Quá trình tuần tra, kiểm soát, bắt giữ bảo đảm tuyệt đối an toàn về người và phương tiện.

Thời gian gần đây, Hải đoàn tập trung nâng cao chất lượng công tác nắm tình hình, nhất là các đối tượng tàu, thuyền đánh cá nước ngoài vào vùng biển Việt Nam; tăng cường nắm tình hình đối tượng buôn bán xăng dầu, than, khoáng sản trên vùng biển Quảng Ninh, Hải Phòng, Nghệ An và Thanh Hóa. Các hoạt động bảo vệ chủ quyền, an ninh vùng biển và đấu tranh chống buôn lậu, gian lận thương mại đều được thực hiện tốt. Cán bộ, chiến sĩ duy trì nghiêm chế độ thường trực sẵn sàng chiến đấu, tích cực luyện tập các phương án tác chiến, phòng chống bão lụt, bảo vệ đơn vị tuyệt đối an toàn, chủ động đối phó có hiệu quả các tình huống khi có mưa bão xảy ra.

Hải đoàn thường xuyên phối hợp cấp ủy, chính quyền, đoàn thể các địa phương tổ chức các hoạt động đền ơn đáp nghĩa, xây dựng nhà Đại đoàn kết, nhà Tình nghĩa, nhà Đồng đội cho các gia đình chính sách trên địa bàn đóng quân và quân nhân trong đơn vị. Các thiết chế văn hóa thường xuyên được củng cố, nơi ăn, ở, sinh hoạt, cảnh quan, môi trường ngày càng chính quy, thống nhất, xanh, sạch, đẹp. Các hoạt động văn hóa, văn nghệ, thể dục, thể thao được duy trì thường xuyên, nâng cao đời sống văn hóa, tinh thần của bộ đội.

Cán bộ, chiến sĩ thực hiện nghiêm túc các quy định về xây dựng đơn vị nền nếp chính quy, vững mạnh toàn diện, sáu năm liên tục được công nhận là đơn vị huấn luyện giỏi, chín năm liền đạt đơn vị vững mạnh toàn diện, được Bộ Quốc phòng tặng Bằng khen, Bộ Tư lệnh Bộ đội Biên phòng tặng Bằng khen và Cờ thi đua.

Với tinh thần đoàn kết, thống nhất, Đảng ủy, Ban chỉ huy Hải đoàn, cấp ủy, chỉ huy các đơn vị và cán bộ, chiến sĩ trong toàn Hải đoàn đã khắc phục mọi khó khăn, gian khổ hoàn thành tốt mọi nhiệm vụ được giao. Cán bộ, chiến sĩ Hải đoàn đã lập được nhiều chiến công xuất sắc, được Đảng và Nhà nước tặng thưởng huân chương, huy chương.

Nhân dịp kỷ niệm 20 năm ngày thành lập, Hải đoàn 38 được tặng thưởng Huân chương Bảo vệ Tổ quốc hạng Nhì. Nhiều cán bộ, chiến sĩ được cấp trên khen thưởng.